Reaction Mechanism of [NiFe] Hydrogenase Studied by Computational Methods.
[NiFe]ヒドロゲナーゼによる水素分子の可逆的な分解反応を、QM/MM法および大規模QM計算(QM領域819原子)を用いて解析した。自由エネルギーは熱力学サイクル摂動計算により算出し、電子構造はDMRG-CASSCF法で検討した。Ni-L状態は反応経路に関与せず、Ni-C状態からの1電子還元後に架橋ヒドリドイオンがCys546硫黄原子へプロトンとして移動し、2電子がNiイオンへ転移する過程が律速段階(エネルギー障壁58 kJ/mol)であることが示された。H-H結合開裂の障壁は33 kJ/molと低く、反応エネルギーはQM系のサイズや汎関数の選択に依存することも確認された。
Ni-C状態の1電子還元後、架橋ヒドリドがCys546硫黄へプロトン移動し2電子がNiへ転移する過程が律速段階(58 kJ/mol)であり、H-H結合開裂は33 kJ/molの低障壁で進行する。
投与経路の特定が困難な研究です。水素摂取の経路として吸入が最も効率的とされますが、吸入応用にあたっては爆発リスクに注意が必要です(LFL 実証値 10%、高濃度機は非推奨)。
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